{"id":887,"date":"2023-08-08T07:37:43","date_gmt":"2023-08-08T07:37:43","guid":{"rendered":"https:\/\/www.gptmain.news\/?p=887"},"modified":"2023-08-08T07:37:43","modified_gmt":"2023-08-08T07:37:43","slug":"%d0%b3%d0%b5%d0%bd%d0%b5%d1%80%d0%b0%d1%86%d0%b8%d1%8f-3d-%d0%bc%d0%be%d0%bb%d0%b5%d0%ba%d1%83%d0%bb%d1%8f%d1%80%d0%bd%d1%8b%d1%85-%d0%ba%d0%be%d0%bd%d1%84%d0%be%d1%80%d0%bc%d0%b5%d1%80%d0%be%d0%b2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/gptmain.news\/?p=887","title":{"rendered":"\u0413\u0435\u043d\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u044f 3D-\u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u044b\u0445 \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440\u043e\u0432 \u0441 \u043f\u043e\u043c\u043e\u0449\u044c\u044e \u044d\u043a\u0432\u0438\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u043e\u0439 \u0433\u0440\u0443\u0431\u043e\u0439 \u0434\u0435\u0442\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u0438 \u0438 \u0430\u0433\u0440\u0435\u0433\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u043e\u0433\u043e \u0432\u043d\u0438\u043c\u0430\u043d\u0438\u044f \u2014 \u0411\u043b\u043e\u0433 \u0438\u0441\u0441\u043b\u0435\u0434\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0438\u0441\u043a\u0443\u0441\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e\u0433\u043e \u0438\u043d\u0442\u0435\u043b\u043b\u0435\u043a\u0442\u0430 \u0411\u0435\u0440\u043a\u043b\u0438\n | GPTMain News"},"content":{"rendered":"<div id=\"\">\n  <!-- twitter --><br \/>\n<meta name=\"twitter:title\" content=\"Generating 3D Molecular Conformers via Equivariant Coarse-Graining and Aggregated Attention\"\/><\/p>\n<p><meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\"\/><\/p>\n<p><meta name=\"twitter:image\" content=\"\/assets\/coarsenconf\/schematic.pdf\"\/><\/p>\n<p><meta name=\"keywords\" content=\"equivariance, gnn, molecule, coarse, hierachical, geometric deep learning, conditional generation\"\/><\/p>\n<p><meta name=\"description\" content=\"The BAIR Blog\"\/><\/p>\n<p><meta name=\"author\" content=\"Danny Reidenbach, Reidenbach\"\/><\/p>\n<p style=\"text-align:center;\">\n<img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/bair.berkeley.edu\/static\/blog\/coarsenconf\/schematic.png\" width=\"95%\"\/><br \/>\n<!-- <img decoding=\"async\" src=\"http:\/\/bair.berkeley.edu\/CoarsenConf\/schematic.png\" width=\"100%\"> --><br \/>\n<br \/><i><b>\u0420\u0438\u0441\u0443\u043d\u043e\u043a 1: \u0410\u0440\u0445\u0438\u0442\u0435\u043a\u0442\u0443\u0440\u0430 CoarsenConf.<\/b><br \/><\/i><br \/>\n<!-- <b>(I)<\/b> The encoder $q_\\phi(z| X, \\mathcal{R})$ takes the fine-grained (FG) ground truth conformer $X$, RDKit approximate conformer $\\mathcal{R}$ , and coarse-grained (CG) conformer $\\mathcal{C}$ as inputs (derived from $X$ and a predefined CG strategy), and outputs a variable-length equivariant CG representation via equivariant message passing and point convolutions.\n<b>(II)<\/b> Equivariant MLPs are applied to learn the mean and log variance of both the posterior and prior distributions.\n<b>(III)<\/b> The posterior (training) or prior (inference) is sampled and fed into the Channel Selection module, where an attention layer is used to learn the optimal pathway from CG to FG structure.\n<b>(IV)<\/b> Given the FG latent vector and the RDKit approximation, the decoder $p_\\theta(X |\\mathcal{R}, z)$ learns to recover the low-energy FG structure through autoregressive equivariant message passing. The entire model can be trained end-to-end by optimizing the KL divergence of latent distributions and reconstruction error of generated conformers.<\/i> -->\n<\/p>\n<p>\u0413\u0435\u043d\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u044f \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u044b\u0445 \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440\u043e\u0432 \u044f\u0432\u043b\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u0444\u0443\u043d\u0434\u0430\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447\u0435\u0439 \u0432\u044b\u0447\u0438\u0441\u043b\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u0445\u0438\u043c\u0438\u0438.  \u0426\u0435\u043b\u044c \u0441\u043e\u0441\u0442\u043e\u0438\u0442 \u0432 \u0442\u043e\u043c, \u0447\u0442\u043e\u0431\u044b \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u043a\u0430\u0437\u0430\u0442\u044c \u0441\u0442\u0430\u0431\u0438\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u043d\u0438\u0437\u043a\u043e\u044d\u043d\u0435\u0440\u0433\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0435 \u0442\u0440\u0435\u0445\u043c\u0435\u0440\u043d\u044b\u0435 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u044b\u0435 \u0441\u0442\u0440\u0443\u043a\u0442\u0443\u0440\u044b, \u0438\u0437\u0432\u0435\u0441\u0442\u043d\u044b\u0435 \u043a\u0430\u043a \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440\u044b, \u0441 \u0443\u0447\u0435\u0442\u043e\u043c \u0434\u0432\u0443\u043c\u0435\u0440\u043d\u043e\u0439 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044b.  \u0422\u043e\u0447\u043d\u044b\u0435 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u044b\u0435 \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438 \u0438\u043c\u0435\u044e\u0442 \u0440\u0435\u0448\u0430\u044e\u0449\u0435\u0435 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0434\u043b\u044f \u0440\u0430\u0437\u043b\u0438\u0447\u043d\u044b\u0445 \u043f\u0440\u0438\u043b\u043e\u0436\u0435\u043d\u0438\u0439, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0437\u0430\u0432\u0438\u0441\u044f\u0442 \u043e\u0442 \u0442\u043e\u0447\u043d\u044b\u0445 \u043f\u0440\u043e\u0441\u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0438 \u0433\u0435\u043e\u043c\u0435\u0442\u0440\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0445 \u0445\u0430\u0440\u0430\u043a\u0442\u0435\u0440\u0438\u0441\u0442\u0438\u043a, \u0432\u043a\u043b\u044e\u0447\u0430\u044f \u043e\u0442\u043a\u0440\u044b\u0442\u0438\u0435 \u043b\u0435\u043a\u0430\u0440\u0441\u0442\u0432 \u0438 \u0441\u0442\u044b\u043a\u043e\u0432\u043a\u0443 \u0431\u0435\u043b\u043a\u043e\u0432.<\/p>\n<p>\u041c\u044b \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u044f\u0435\u043c CoarsenConf, SE (3)-\u044d\u043a\u0432\u0438\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u044b\u0439 \u0438\u0435\u0440\u0430\u0440\u0445\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0439 \u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u0446\u0438\u043e\u043d\u043d\u044b\u0439 \u0430\u0432\u0442\u043e\u044d\u043d\u043a\u043e\u0434\u0435\u0440 (VAE), \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0439 \u043e\u0431\u044a\u0435\u0434\u0438\u043d\u044f\u0435\u0442 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044e \u043e\u0442 \u043c\u0435\u043b\u043a\u0438\u0445 \u0430\u0442\u043e\u043c\u043d\u044b\u0445 \u043a\u043e\u043e\u0440\u0434\u0438\u043d\u0430\u0442 \u0434\u043e \u043a\u0440\u0443\u043f\u043d\u043e\u0437\u0435\u0440\u043d\u0438\u0441\u0442\u043e\u0433\u043e \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f \u0443\u0440\u043e\u0432\u043d\u044f \u043f\u043e\u0434\u0433\u0440\u0430\u0444\u0430 \u0434\u043b\u044f \u044d\u0444\u0444\u0435\u043a\u0442\u0438\u0432\u043d\u043e\u0439 \u0430\u0432\u0442\u043e\u0440\u0435\u0433\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u043e\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u0438 \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440\u043e\u0432.<\/p>\n<p><!--more--><\/p>\n<h2 id=\"background\">\u0424\u043e\u043d<\/h2>\n<p>\u0413\u0440\u0443\u0431\u0430\u044f \u0434\u0435\u0442\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u044f \u0443\u043c\u0435\u043d\u044c\u0448\u0430\u0435\u0442 \u0440\u0430\u0437\u043c\u0435\u0440\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c \u043f\u0440\u043e\u0431\u043b\u0435\u043c\u044b, \u043f\u043e\u0437\u0432\u043e\u043b\u044f\u044f \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0443\u0441\u043b\u043e\u0432\u043d\u0443\u044e \u0430\u0432\u0442\u043e\u0440\u0435\u0433\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u043e\u043d\u043d\u0443\u044e \u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u044e, \u0430 \u043d\u0435 \u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0432\u0441\u0435 \u043a\u043e\u043e\u0440\u0434\u0438\u043d\u0430\u0442\u044b \u043d\u0435\u0437\u0430\u0432\u0438\u0441\u0438\u043c\u043e, \u043a\u0430\u043a \u044d\u0442\u043e \u0434\u0435\u043b\u0430\u043b\u043e\u0441\u044c \u0432 \u043f\u0440\u0435\u0434\u044b\u0434\u0443\u0449\u0435\u0439 \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u0435.  \u041f\u0443\u0442\u0435\u043c \u043f\u0440\u044f\u043c\u043e\u0433\u043e \u043e\u0431\u0443\u0441\u043b\u043e\u0432\u043b\u0438\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0442\u0440\u0435\u0445\u043c\u0435\u0440\u043d\u044b\u0445 \u043a\u043e\u043e\u0440\u0434\u0438\u043d\u0430\u0442 \u0440\u0430\u043d\u0435\u0435 \u0441\u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043f\u043e\u0434\u0433\u0440\u0430\u0444\u043e\u0432 \u043d\u0430\u0448\u0430 \u043c\u043e\u0434\u0435\u043b\u044c \u043b\u0443\u0447\u0448\u0435 \u043e\u0431\u043e\u0431\u0449\u0430\u0435\u0442 \u0445\u0438\u043c\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438 \u0438 \u043f\u0440\u043e\u0441\u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e \u0441\u0445\u043e\u0436\u0438\u0435 \u043f\u043e\u0434\u0433\u0440\u0430\u0444\u044b.  \u042d\u0442\u043e \u0438\u043c\u0438\u0442\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442 \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u043d\u043e\u0439 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u043e\u0433\u043e \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0430, \u043a\u043e\u0433\u0434\u0430 \u043d\u0435\u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u0438\u0435 \u0444\u0443\u043d\u043a\u0446\u0438\u043e\u043d\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u0435\u0434\u0438\u043d\u0438\u0446\u044b \u0441\u043e\u0435\u0434\u0438\u043d\u044f\u044e\u0442\u0441\u044f \u0432\u043c\u0435\u0441\u0442\u0435, \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0443\u044f \u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u0438\u0435 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044b, \u043f\u043e\u0434\u043e\u0431\u043d\u044b\u0435 \u043b\u0435\u043a\u0430\u0440\u0441\u0442\u0432\u0430\u043c.  \u0412 \u043e\u0442\u043b\u0438\u0447\u0438\u0435 \u043e\u0442 \u043f\u0440\u0435\u0434\u044b\u0434\u0443\u0449\u0438\u0445 \u043c\u0435\u0442\u043e\u0434\u043e\u0432, CoarsenConf \u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442 \u043d\u0438\u0437\u043a\u043e\u044d\u043d\u0435\u0440\u0433\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0435 \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440\u044b \u0441 \u0432\u043e\u0437\u043c\u043e\u0436\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c\u044e \u043f\u0440\u044f\u043c\u043e\u0433\u043e \u043c\u043e\u0434\u0435\u043b\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0430\u0442\u043e\u043c\u043d\u044b\u0445 \u043a\u043e\u043e\u0440\u0434\u0438\u043d\u0430\u0442, \u0440\u0430\u0441\u0441\u0442\u043e\u044f\u043d\u0438\u0439 \u0438 \u0442\u043e\u0440\u0441\u0438\u043e\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0443\u0433\u043b\u043e\u0432.<\/p>\n<p>\u0410\u0440\u0445\u0438\u0442\u0435\u043a\u0442\u0443\u0440\u0443 CoarsenConf \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u0440\u0430\u0437\u0431\u0438\u0442\u044c \u043d\u0430 \u0441\u043b\u0435\u0434\u0443\u044e\u0449\u0438\u0435 \u043a\u043e\u043c\u043f\u043e\u043d\u0435\u043d\u0442\u044b:<br \/><b>(\u042f)<\/b> \u041a\u043e\u0434\u0438\u0440\u043e\u0432\u0449\u0438\u043a $q_\\phi(z| X, \\mathcal{R})$ \u043f\u0440\u0438\u043d\u0438\u043c\u0430\u0435\u0442 \u043c\u0435\u043b\u043a\u043e\u0437\u0435\u0440\u043d\u0438\u0441\u0442\u044b\u0439 (FG) \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440 \u0438\u0441\u0442\u0438\u043d\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438 \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f $X$, \u043f\u0440\u0438\u0431\u043b\u0438\u0436\u0435\u043d\u043d\u044b\u0439 \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440 RDKit $\\mathcal{R}$ \u0438 \u043a\u0440\u0443\u043f\u043d\u043e\u0437\u0435\u0440\u043d\u0438\u0441\u0442\u044b\u0439 (CG ) \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440 $\\mathcal{C}$ \u0432 \u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435 \u0432\u0445\u043e\u0434\u043d\u044b\u0445 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 (\u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0435\u043d\u043d\u044b\u0439 \u0438\u0437 $X$ \u0438 \u043f\u0440\u0435\u0434\u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0441\u0442\u0440\u0430\u0442\u0435\u0433\u0438\u0438 CG) \u0438 \u0432\u044b\u0432\u043e\u0434\u0438\u0442 \u044d\u043a\u0432\u0438\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u043e\u0435 \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u0438\u0435 CG \u043f\u0435\u0440\u0435\u043c\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0434\u043b\u0438\u043d\u044b \u043f\u043e\u0441\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0432\u043e\u043c \u044d\u043a\u0432\u0438\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u043e\u0439 \u043f\u0435\u0440\u0435\u0434\u0430\u0447\u0438 \u0441\u043e\u043e\u0431\u0449\u0435\u043d\u0438\u0439 \u0438 \u0442\u043e\u0447\u0435\u0447\u043d\u044b\u0445 \u0441\u0432\u0435\u0440\u0442\u043e\u043a.<br \/><b>(II)<\/b> \u042d\u043a\u0432\u0438\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u044b\u0435 MLP \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u044f\u044e\u0442\u0441\u044f \u0434\u043b\u044f \u0438\u0437\u0443\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f \u0441\u0440\u0435\u0434\u043d\u0435\u0433\u043e \u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f \u0438 \u043b\u043e\u0433\u0430\u0440\u0438\u0444\u043c\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u043e\u0439 \u0434\u0438\u0441\u043f\u0435\u0440\u0441\u0438\u0438 \u043a\u0430\u043a \u0430\u043f\u043e\u0441\u0442\u0435\u0440\u0438\u043e\u0440\u043d\u043e\u0433\u043e, \u0442\u0430\u043a \u0438 \u0430\u043f\u0440\u0438\u043e\u0440\u043d\u043e\u0433\u043e \u0440\u0430\u0441\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f.<br \/><b>(III)<\/b> \u0410\u043f\u043e\u0441\u0442\u0435\u0440\u0438\u043e\u0440\u043d\u0430\u044f (\u043e\u0431\u0443\u0447\u0435\u043d\u0438\u0435) \u0438\u043b\u0438 \u043f\u0440\u0435\u0434\u0448\u0435\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0449\u0430\u044f (\u0432\u044b\u0432\u043e\u0434) \u0432\u044b\u0431\u043e\u0440\u043a\u0430 \u0438 \u043f\u043e\u0434\u0430\u0447\u0430 \u0432 \u043c\u043e\u0434\u0443\u043b\u044c \u0432\u044b\u0431\u043e\u0440\u0430 \u043a\u0430\u043d\u0430\u043b\u0430, \u0433\u0434\u0435 \u0443\u0440\u043e\u0432\u0435\u043d\u044c \u0432\u043d\u0438\u043c\u0430\u043d\u0438\u044f \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u0434\u043b\u044f \u0438\u0437\u0443\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f \u043e\u043f\u0442\u0438\u043c\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0433\u043e \u043f\u0443\u0442\u0438 \u043e\u0442 \u0441\u0442\u0440\u0443\u043a\u0442\u0443\u0440\u044b CG \u043a \u0441\u0442\u0440\u0443\u043a\u0442\u0443\u0440\u0435 FG.<br \/><b>(IV)<\/b> \u0423\u0447\u0438\u0442\u044b\u0432\u0430\u044f \u0441\u043a\u0440\u044b\u0442\u044b\u0439 \u0432\u0435\u043a\u0442\u043e\u0440 FG \u0438 \u043f\u0440\u0438\u0431\u043b\u0438\u0436\u0435\u043d\u0438\u0435 RDKit, \u0434\u0435\u043a\u043e\u0434\u0435\u0440 $p_\\theta(X |\\mathcal{R}, z)$ \u0443\u0447\u0438\u0442\u0441\u044f \u0432\u043e\u0441\u0441\u0442\u0430\u043d\u0430\u0432\u043b\u0438\u0432\u0430\u0442\u044c \u043d\u0438\u0437\u043a\u043e\u044d\u043d\u0435\u0440\u0433\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0443\u044e \u0441\u0442\u0440\u0443\u043a\u0442\u0443\u0440\u0443 FG \u043f\u043e\u0441\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0432\u043e\u043c \u0430\u0432\u0442\u043e\u0440\u0435\u0433\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u043e\u043d\u043d\u043e\u0439 \u044d\u043a\u0432\u0438\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u043e\u0439 \u043f\u0435\u0440\u0435\u0434\u0430\u0447\u0438 \u0441\u043e\u043e\u0431\u0449\u0435\u043d\u0438\u0439.  \u0412\u0441\u044e \u043c\u043e\u0434\u0435\u043b\u044c \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043e\u0431\u0443\u0447\u0438\u0442\u044c \u043e\u0442 \u043d\u0430\u0447\u0430\u043b\u0430 \u0434\u043e \u043a\u043e\u043d\u0446\u0430, \u043e\u043f\u0442\u0438\u043c\u0438\u0437\u0438\u0440\u0443\u044f KL-\u0440\u0430\u0441\u0445\u043e\u0436\u0434\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0441\u043a\u0440\u044b\u0442\u044b\u0445 \u0440\u0430\u0441\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u0438\u0439 \u0438 \u043e\u0448\u0438\u0431\u043a\u0443 \u0440\u0435\u043a\u043e\u043d\u0441\u0442\u0440\u0443\u043a\u0446\u0438\u0438 \u0441\u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440\u043e\u0432.<\/p>\n<h2 id=\"mcg-task-formalism\">\u0424\u043e\u0440\u043c\u0430\u043b\u0438\u0437\u043c \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447 MCG<\/h2>\n<p>\u041c\u044b \u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u043b\u0438\u0437\u0443\u0435\u043c \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447\u0443 \u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u0438 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u043e\u0433\u043e \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440\u0430 (MCG) \u043a\u0430\u043a \u043c\u043e\u0434\u0435\u043b\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0443\u0441\u043b\u043e\u0432\u043d\u043e\u0433\u043e \u0440\u0430\u0441\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f $p(X|\\mathcal{R})$, \u0433\u0434\u0435 $\\mathcal{R}$ \u2014 \u043f\u0440\u0438\u0431\u043b\u0438\u0436\u0435\u043d\u043d\u044b\u0439 \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440, \u0441\u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u0439 RDKit, \u0430 $X$ \u2014 \u043e\u043f\u0442\u0438\u043c\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0439 \u043d\u0438\u0437\u043a\u043e\u044d\u043d\u0435\u0440\u0433\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0439 \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440(\u044b).  RDKit, \u0448\u0438\u0440\u043e\u043a\u043e \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u043c\u0430\u044f \u0431\u0438\u0431\u043b\u0438\u043e\u0442\u0435\u043a\u0430 \u0445\u0435\u043c\u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0438\u043a\u0438, \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u0442 \u0434\u0435\u0448\u0435\u0432\u044b\u0439 \u0430\u043b\u0433\u043e\u0440\u0438\u0442\u043c, \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u0439 \u043d\u0430 \u0433\u0435\u043e\u043c\u0435\u0442\u0440\u0438\u0438 \u0440\u0430\u0441\u0441\u0442\u043e\u044f\u043d\u0438\u044f, \u0437\u0430 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u043c \u0441\u043b\u0435\u0434\u0443\u0435\u0442 \u043d\u0435\u0434\u043e\u0440\u043e\u0433\u0430\u044f \u043e\u043f\u0442\u0438\u043c\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u044f, \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u0430\u044f \u043d\u0430 \u0444\u0438\u0437\u0438\u043a\u0435, \u0434\u043b\u044f \u0434\u043e\u0441\u0442\u0438\u0436\u0435\u043d\u0438\u044f \u0440\u0430\u0437\u0443\u043c\u043d\u044b\u0445 \u043f\u0440\u0438\u0431\u043b\u0438\u0436\u0435\u043d\u0438\u0439 \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440\u043e\u0432.<\/p>\n<h2 id=\"coarse-graining\">\u041a\u0440\u0443\u043f\u043d\u043e\u0437\u0435\u0440\u043d\u0438\u0441\u0442\u044b\u0439<\/h2>\n<p style=\"text-align:center;\">\n<img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/bair.berkeley.edu\/static\/blog\/coarsenconf\/figure2.png\" width=\"95%\"\/><br \/>\n<!-- <img decoding=\"async\" src=\"http:\/\/bair.berkeley.edu\/CoarsenConf\/figure2.png\" width=\"95%\"> --><br \/>\n<br \/><i><b>\u0420\u0438\u0441\u0443\u043d\u043e\u043a 2: \u041f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0434\u0443\u0440\u0430 \u0433\u0440\u0443\u0431\u043e\u0439 \u0448\u043b\u0438\u0444\u043e\u0432\u043a\u0438.<\/b> <!-- <br \/><\/i>--><br \/>\n<b>(\u042f)<\/b> \u041f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440 \u043a\u0440\u0443\u043f\u043d\u043e\u0437\u0435\u0440\u043d\u0438\u0441\u0442\u043e\u0441\u0442\u0438 \u043f\u0435\u0440\u0435\u043c\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0434\u043b\u0438\u043d\u044b.  \u041c\u0435\u043b\u043a\u043e\u0437\u0435\u0440\u043d\u0438\u0441\u0442\u044b\u0435 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044b \u0440\u0430\u0441\u0449\u0435\u043f\u043b\u0435\u043d\u044b \u043f\u043e \u0432\u0440\u0430\u0449\u0430\u044e\u0449\u0438\u043c\u0441\u044f \u0441\u0432\u044f\u0437\u044f\u043c, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u044f\u044e\u0442 \u0442\u043e\u0440\u0441\u0438\u043e\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0443\u0433\u043b\u044b.  \u0417\u0430\u0442\u0435\u043c \u043e\u043d\u0438 \u043f\u043e\u0434\u0432\u0435\u0440\u0433\u0430\u044e\u0442\u0441\u044f \u0433\u0440\u0443\u0431\u043e\u0439 \u0434\u0435\u0442\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u0438, \u0447\u0442\u043e\u0431\u044b \u0443\u043c\u0435\u043d\u044c\u0448\u0438\u0442\u044c \u0440\u0430\u0437\u043c\u0435\u0440\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c \u0438 \u0438\u0437\u0443\u0447\u0438\u0442\u044c \u0441\u043a\u0440\u044b\u0442\u043e\u0435 \u0440\u0430\u0441\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u0438\u0435 \u043d\u0430 \u0443\u0440\u043e\u0432\u043d\u0435 \u043f\u043e\u0434\u0433\u0440\u0430\u0444\u0430. <b>(II)<\/b> \u0412\u0438\u0437\u0443\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u044f 3D \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440\u0430.  \u041e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u043d\u044b\u0435 \u043f\u0430\u0440\u044b \u0430\u0442\u043e\u043c\u043e\u0432 \u0432\u044b\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u044b \u0434\u043b\u044f \u043e\u043f\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u0439 \u043f\u0435\u0440\u0435\u0434\u0430\u0447\u0438 \u0441\u043e\u043e\u0431\u0449\u0435\u043d\u0438\u0439 \u0434\u0435\u043a\u043e\u0434\u0435\u0440\u0430.<\/i>\n<\/p>\n<p><!-- <b>Figure 2(I)<\/b> illustrates an example of coarse-graining. Fine-grain molecules are split along rotatable bonds that define torsion angles. They are then coarse-grained to reduce the dimensionality and learn a subgraph-level latent distribution. <b>Figure 2(II)<\/b> demonstrates the visualization of a 3D conformer. Specific atom pairs are highlighted for decoder message-passing operations. --><\/p>\n<p>\u041c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u0430\u044f \u043a\u0440\u0443\u043f\u043d\u043e\u0437\u0435\u0440\u043d\u0438\u0441\u0442\u043e\u0441\u0442\u044c \u0443\u043f\u0440\u043e\u0449\u0430\u0435\u0442 \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u0438\u0435 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044b \u0437\u0430 \u0441\u0447\u0435\u0442 \u0433\u0440\u0443\u043f\u043f\u0438\u0440\u043e\u0432\u043a\u0438 \u043c\u0435\u043b\u043a\u043e\u0437\u0435\u0440\u043d\u0438\u0441\u0442\u044b\u0445 (\u041c\u0417) \u0430\u0442\u043e\u043c\u043e\u0432 \u0432 \u0438\u0441\u0445\u043e\u0434\u043d\u043e\u0439 \u0441\u0442\u0440\u0443\u043a\u0442\u0443\u0440\u0435 \u0432 \u043e\u0442\u0434\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u043a\u0440\u0443\u043f\u043d\u043e\u0437\u0435\u0440\u043d\u0438\u0441\u0442\u044b\u0435 (\u041a\u0417) \u0448\u0430\u0440\u0438\u043a\u0438 $\\mathcal{B}$ \u0441 \u0441\u043e\u043f\u043e\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u0438\u0435\u043c \u043d\u0430 \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u0435 \u043f\u0440\u0430\u0432\u0438\u043b, \u043a\u0430\u043a \u043f\u043e\u043a\u0430\u0437\u0430\u043d\u043e \u043d\u0430 \u0440\u0438\u0441. 2. (\u042f).  \u0413\u0440\u0443\u0431\u0430\u044f \u0434\u0435\u0442\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u044f \u0448\u0438\u0440\u043e\u043a\u043e \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u0432 \u0431\u0435\u043b\u043a\u043e\u0432\u043e\u043c \u0438 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u043e\u043c \u0434\u0438\u0437\u0430\u0439\u043d\u0435, \u0438, \u0430\u043d\u0430\u043b\u043e\u0433\u0438\u0447\u043d\u043e, \u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u044f \u043d\u0430 \u0443\u0440\u043e\u0432\u043d\u0435 \u0444\u0440\u0430\u0433\u043c\u0435\u043d\u0442\u043e\u0432 \u0438\u043b\u0438 \u043f\u043e\u0434\u0433\u0440\u0430\u0444\u043e\u0432 \u043e\u043a\u0430\u0437\u0430\u043b\u0430\u0441\u044c \u043e\u0447\u0435\u043d\u044c \u0446\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0432 \u0440\u0430\u0437\u043b\u0438\u0447\u043d\u044b\u0445 \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447\u0430\u0445 \u0434\u0432\u0443\u043c\u0435\u0440\u043d\u043e\u0433\u043e \u0434\u0438\u0437\u0430\u0439\u043d\u0430 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b.  \u0420\u0430\u0437\u0431\u0438\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0430\u0442\u0438\u0432\u043d\u044b\u0445 \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447 \u043d\u0430 \u0431\u043e\u043b\u0435\u0435 \u043c\u0435\u043b\u043a\u0438\u0435 \u0447\u0430\u0441\u0442\u0438 \u2014 \u044d\u0442\u043e \u043f\u043e\u0434\u0445\u043e\u0434, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0439 \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0435\u043d \u043a \u043d\u0435\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u0438\u043c \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447\u0430\u043c \u0442\u0440\u0435\u0445\u043c\u0435\u0440\u043d\u044b\u0445 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u0438 \u043e\u0431\u0435\u0441\u043f\u0435\u0447\u0438\u0432\u0430\u0435\u0442 \u0435\u0441\u0442\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e\u0435 \u0443\u043c\u0435\u043d\u044c\u0448\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0440\u0430\u0437\u043c\u0435\u0440\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438 \u0434\u043b\u044f \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u044b \u0441 \u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u0438\u043c\u0438 \u0441\u043b\u043e\u0436\u043d\u044b\u043c\u0438 \u0441\u0438\u0441\u0442\u0435\u043c\u0430\u043c\u0438.<\/p>\n<p>\u041c\u044b \u043e\u0442\u043c\u0435\u0447\u0430\u0435\u043c, \u0447\u0442\u043e \u043f\u043e \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u044e \u0441 \u043f\u0440\u0435\u0434\u044b\u0434\u0443\u0449\u0438\u043c\u0438 \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u0430\u043c\u0438, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0441\u043e\u0441\u0440\u0435\u0434\u043e\u0442\u043e\u0447\u0435\u043d\u044b \u043d\u0430 \u0441\u0442\u0440\u0430\u0442\u0435\u0433\u0438\u044f\u0445 CG \u0441 \u0444\u0438\u043a\u0441\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0434\u043b\u0438\u043d\u043e\u0439, \u0433\u0434\u0435 \u043a\u0430\u0436\u0434\u0430\u044f \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u0430 \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u0430 \u200b\u200b\u0441 \u0444\u0438\u043a\u0441\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c \u0440\u0430\u0437\u0440\u0435\u0448\u0435\u043d\u0438\u0435\u043c $N$ \u0437\u0435\u0440\u0435\u043d CG, \u043d\u0430\u0448 \u043c\u0435\u0442\u043e\u0434 \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u0442 CG \u043f\u0435\u0440\u0435\u043c\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0434\u043b\u0438\u043d\u044b \u0438\u0437-\u0437\u0430 \u0435\u0433\u043e \u0433\u0438\u0431\u043a\u043e\u0441\u0442\u0438 \u0438 \u0441\u043f\u043e\u0441\u043e\u0431\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438 \u043f\u043e\u0434\u0434\u0435\u0440\u0436\u0438\u0432\u0430\u0442\u044c \u043b\u044e\u0431\u043e\u0439 \u0432\u044b\u0431\u043e\u0440 \u0433\u0440\u0443\u0431\u044b\u0445 \u0437\u0435\u0440\u0435\u043d. \u0442\u0435\u0445\u043d\u0438\u043a\u0430 \u0437\u0435\u0440\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f.  \u042d\u0442\u043e \u043e\u0437\u043d\u0430\u0447\u0430\u0435\u0442, \u0447\u0442\u043e \u043e\u0434\u043d\u0443 \u043c\u043e\u0434\u0435\u043b\u044c CoarsenConf \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043e\u0431\u043e\u0431\u0449\u0438\u0442\u044c \u0434\u043e \u043b\u044e\u0431\u043e\u0433\u043e \u043a\u0440\u0443\u043f\u043d\u043e\u0437\u0435\u0440\u043d\u0438\u0441\u0442\u043e\u0433\u043e \u0440\u0430\u0437\u0440\u0435\u0448\u0435\u043d\u0438\u044f, \u043f\u043e\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u0443 \u0432\u0445\u043e\u0434\u043d\u044b\u0435 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044b \u043c\u043e\u0433\u0443\u0442 \u0441\u043e\u043f\u043e\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u044f\u0442\u044c\u0441\u044f \u0441 \u043b\u044e\u0431\u044b\u043c \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e\u043c \u0448\u0430\u0440\u0438\u043a\u043e\u0432 \u043a\u043e\u043c\u043f\u044c\u044e\u0442\u0435\u0440\u043d\u043e\u0439 \u0433\u0440\u0430\u0444\u0438\u043a\u0438.  \u0412 \u043d\u0430\u0448\u0435\u043c \u0441\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435 \u0430\u0442\u043e\u043c\u044b, \u0441\u043e\u0441\u0442\u043e\u044f\u0449\u0438\u0435 \u0438\u0437 \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u0441\u0432\u044f\u0437\u0430\u043d\u043d\u043e\u0433\u043e \u043a\u043e\u043c\u043f\u043e\u043d\u0435\u043d\u0442\u0430, \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u043e\u0432\u0430\u0432\u0448\u0435\u0433\u043e\u0441\u044f \u0432 \u0440\u0435\u0437\u0443\u043b\u044c\u0442\u0430\u0442\u0435 \u0440\u0430\u0437\u0440\u044b\u0432\u0430 \u0432\u0441\u0435\u0445 \u0432\u0440\u0430\u0449\u0430\u044e\u0449\u0438\u0445\u0441\u044f \u0441\u0432\u044f\u0437\u0435\u0439, \u0443\u043a\u0440\u0443\u043f\u043d\u044f\u044e\u0442\u0441\u044f \u0432 \u0435\u0434\u0438\u043d\u044b\u0439 \u0448\u0430\u0440\u0438\u043a.  \u042d\u0442\u043e\u0442 \u0432\u044b\u0431\u043e\u0440 \u0432 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0434\u0443\u0440\u0435 \u043a\u043e\u043c\u043f\u044c\u044e\u0442\u0435\u0440\u043d\u043e\u0439 \u0433\u0440\u0430\u0444\u0438\u043a\u0438 \u043d\u0435\u044f\u0432\u043d\u043e \u0437\u0430\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u044f\u0435\u0442 \u043c\u043e\u0434\u0435\u043b\u044c \u0438\u0437\u0443\u0447\u0430\u0442\u044c \u0443\u0433\u043b\u044b \u043a\u0440\u0443\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f, \u0430 \u0442\u0430\u043a\u0436\u0435 \u043a\u043e\u043e\u0440\u0434\u0438\u043d\u0430\u0442\u044b \u0430\u0442\u043e\u043c\u043e\u0432 \u0438 \u043c\u0435\u0436\u0430\u0442\u043e\u043c\u043d\u044b\u0435 \u0440\u0430\u0441\u0441\u0442\u043e\u044f\u043d\u0438\u044f.  \u0412 \u043d\u0430\u0448\u0438\u0445 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430\u0445 \u043c\u044b \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u043c GEOM-QM9 \u0438 GEOM-DRUGS, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0432 \u0441\u0440\u0435\u0434\u043d\u0435\u043c \u0438\u043c\u0435\u044e\u0442 11 \u0430\u0442\u043e\u043c\u043e\u0432 \u0438 3 \u0433\u0440\u0430\u043d\u0443\u043b\u044b CG \u0438 44 \u0430\u0442\u043e\u043c\u0430 \u0438 9 \u0431\u0443\u0441\u0438\u043d\u043e\u043a CG \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e.<\/p>\n<h2 id=\"se3-equivariance\">SE(3)-\u044d\u043a\u0432\u0438\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c<\/h2>\n<p>\u041a\u043b\u044e\u0447\u0435\u0432\u044b\u043c \u0430\u0441\u043f\u0435\u043a\u0442\u043e\u043c \u043f\u0440\u0438 \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u0435 \u0441 \u0442\u0440\u0435\u0445\u043c\u0435\u0440\u043d\u044b\u043c\u0438 \u0441\u0442\u0440\u0443\u043a\u0442\u0443\u0440\u0430\u043c\u0438 \u044f\u0432\u043b\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u043f\u043e\u0434\u0434\u0435\u0440\u0436\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0449\u0435\u0439 \u044d\u043a\u0432\u0438\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438.  \u0422\u0440\u0435\u0445\u043c\u0435\u0440\u043d\u044b\u0435 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044b \u044d\u043a\u0432\u0438\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u044b \u043e\u0442\u043d\u043e\u0441\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e \u0432\u0440\u0430\u0449\u0435\u043d\u0438\u0439 \u0438 \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043b\u044f\u0446\u0438\u0439 \u0438\u043b\u0438 SE(3)-\u044d\u043a\u0432\u0438\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438.  \u041c\u044b \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u044f\u0435\u043c SE(3)-\u044d\u043a\u0432\u0438\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c \u0432 \u043a\u043e\u0434\u0435\u0440\u0435, \u0434\u0435\u043a\u043e\u0434\u0435\u0440\u0435 \u0438 \u0441\u043a\u0440\u044b\u0442\u043e\u043c \u043f\u0440\u043e\u0441\u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u0442\u0432\u0435 \u043d\u0430\u0448\u0435\u0439 \u0432\u0435\u0440\u043e\u044f\u0442\u043d\u043e\u0441\u0442\u043d\u043e\u0439 \u043c\u043e\u0434\u0435\u043b\u0438 CoarsenConf.  \u0412 \u0440\u0435\u0437\u0443\u043b\u044c\u0442\u0430\u0442\u0435 $p(X | \\mathcal{R})$ \u043e\u0441\u0442\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u043d\u0435\u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u043d\u044b\u043c \u043f\u0440\u0438 \u043b\u044e\u0431\u043e\u0439 \u0440\u043e\u0442\u043e\u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043b\u044f\u0446\u0438\u0438 \u043f\u0440\u0438\u0431\u043b\u0438\u0436\u0435\u043d\u043d\u043e\u0433\u043e \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440\u0430 $\\mathcal{R}$.  \u041a\u0440\u043e\u043c\u0435 \u0442\u043e\u0433\u043e, \u0435\u0441\u043b\u0438 $\\mathcal{R}$ \u043f\u043e\u0432\u0435\u0440\u043d\u0443\u0442 \u043f\u043e \u0447\u0430\u0441\u043e\u0432\u043e\u0439 \u0441\u0442\u0440\u0435\u043b\u043a\u0435 \u043d\u0430 90\u00b0, \u043c\u044b \u043e\u0436\u0438\u0434\u0430\u0435\u043c, \u0447\u0442\u043e \u043e\u043f\u0442\u0438\u043c\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0439 \u0443\u0433\u043e\u043b $X$ \u043f\u043e\u0432\u0435\u0440\u043d\u0435\u0442\u0441\u044f \u0442\u0430\u043a \u0436\u0435.  \u041f\u043e\u0434\u0440\u043e\u0431\u043d\u043e\u0435 \u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0438 \u043e\u0431\u0441\u0443\u0436\u0434\u0435\u043d\u0438\u0435 \u043c\u0435\u0442\u043e\u0434\u043e\u0432 \u043f\u043e\u0434\u0434\u0435\u0440\u0436\u0430\u043d\u0438\u044f \u044d\u043a\u0432\u0438\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438 \u0441\u043c. \u0432 \u043f\u043e\u043b\u043d\u043e\u0439 \u0441\u0442\u0430\u0442\u044c\u0435.<\/p>\n<h2 id=\"aggregated-attention\">\u0421\u043e\u0432\u043e\u043a\u0443\u043f\u043d\u043e\u0435 \u0432\u043d\u0438\u043c\u0430\u043d\u0438\u0435<\/h2>\n<p style=\"text-align:center;\">\n<img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/bair.berkeley.edu\/static\/blog\/coarsenconf\/attention.png\" width=\"95%\"\/><br \/>\n<!-- <img decoding=\"async\" src=\"http:\/\/bair.berkeley.edu\/CoarsenConf\/attention.png\" width=\"95%\"> --><br \/>\n<br \/><i><b>\u0420\u0438\u0441. 3. \u041e\u0431\u0440\u0430\u0442\u043d\u043e\u0435 \u0441\u043e\u043f\u043e\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u0438\u0435 \u043f\u0435\u0440\u0435\u043c\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0434\u043b\u0438\u043d\u044b \u043e\u0442 \u0433\u0440\u0443\u0431\u043e\u0433\u043e \u043a \u0442\u043e\u0447\u043d\u043e\u043c\u0443 \u0441 \u043f\u043e\u043c\u043e\u0449\u044c\u044e \u0430\u0433\u0440\u0435\u0433\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u043e\u0433\u043e \u0432\u043d\u0438\u043c\u0430\u043d\u0438\u044f.<\/b><\/i>\n<\/p>\n<p>\u041c\u044b \u0432\u0432\u043e\u0434\u0438\u043c \u043c\u0435\u0442\u043e\u0434, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0439 \u043c\u044b \u043d\u0430\u0437\u044b\u0432\u0430\u0435\u043c \u0430\u0433\u0440\u0435\u0433\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c \u0432\u043d\u0438\u043c\u0430\u043d\u0438\u0435\u043c, \u0434\u043b\u044f \u0438\u0437\u0443\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f \u043e\u043f\u0442\u0438\u043c\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0433\u043e \u043e\u0442\u043e\u0431\u0440\u0430\u0436\u0435\u043d\u0438\u044f \u043f\u0435\u0440\u0435\u043c\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0434\u043b\u0438\u043d\u044b \u0438\u0437 \u0441\u043a\u0440\u044b\u0442\u043e\u0433\u043e \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f CG \u0432 \u043a\u043e\u043e\u0440\u0434\u0438\u043d\u0430\u0442\u044b FG.  \u042d\u0442\u043e \u043e\u043f\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u044f \u0441 \u043f\u0435\u0440\u0435\u043c\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0434\u043b\u0438\u043d\u043e\u0439, \u0442\u0430\u043a \u043a\u0430\u043a \u043e\u0434\u043d\u0430 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u0430 \u0441 $n$ \u0430\u0442\u043e\u043c\u0430\u043c\u0438 \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u043e\u0442\u043e\u0431\u0440\u0430\u0436\u0430\u0442\u044c\u0441\u044f \u043d\u0430 \u043b\u044e\u0431\u043e\u0435 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e $N$ \u0448\u0430\u0440\u0438\u043a\u043e\u0432 CG (\u043a\u0430\u0436\u0434\u044b\u0439 \u0448\u0430\u0440\u0438\u043a \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d \u043e\u0434\u043d\u0438\u043c \u0441\u043a\u0440\u044b\u0442\u044b\u043c \u0432\u0435\u043a\u0442\u043e\u0440\u043e\u043c).  \u0421\u043a\u0440\u044b\u0442\u044b\u0439 \u0432\u0435\u043a\u0442\u043e\u0440 \u043e\u0434\u043d\u043e\u0439 \u0431\u0443\u0441\u0438\u043d\u044b CG $Z_{B}$ $\\in R^{F \\times 3}$ \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u0432 \u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435 \u043a\u043b\u044e\u0447\u0430 \u0438 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f \u043e\u0434\u043d\u043e\u0439 \u043e\u043f\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u0438 \u0432\u043d\u0438\u043c\u0430\u043d\u0438\u044f \u0433\u043e\u043b\u043e\u0432\u044b \u0441 \u0440\u0430\u0437\u043c\u0435\u0440\u043e\u043c \u0432\u043b\u043e\u0436\u0435\u043d\u0438\u044f, \u0440\u0430\u0432\u043d\u044b\u043c \u0442\u0440\u0435\u043c, \u0434\u043b\u044f \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0438\u044f x, \u0443, z \u043a\u043e\u043e\u0440\u0434\u0438\u043d\u0430\u0442\u044b.  \u0412\u0435\u043a\u0442\u043e\u0440 \u0437\u0430\u043f\u0440\u043e\u0441\u0430 \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u044f\u0435\u0442 \u0441\u043e\u0431\u043e\u0439 \u043f\u043e\u0434\u043c\u043d\u043e\u0436\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440\u0430 RDKit, \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0449\u0435\u0433\u043e \u0448\u0430\u0440\u0438\u043a\u0443 $B$ $\\in R^{ n_{B} \\times 3}$, \u0433\u0434\u0435 $n_B$ \u0438\u043c\u0435\u0435\u0442 \u043f\u0435\u0440\u0435\u043c\u0435\u043d\u043d\u0443\u044e \u0434\u043b\u0438\u043d\u0443, \u043f\u043e\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u0443 \u043c\u044b \u0430\u043f\u0440\u0438\u043e\u0440\u0438 \u0437\u043d\u0430\u0435\u043c, \u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u0430\u0442\u043e\u043c\u043e\u0432 FG \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u0435\u0442 \u043a \u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0431\u0443\u0441\u0438\u043d\u0435 CG.  \u0418\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u044f \u0432\u043d\u0438\u043c\u0430\u043d\u0438\u0435, \u043c\u044b \u044d\u0444\u0444\u0435\u043a\u0442\u0438\u0432\u043d\u043e \u0438\u0437\u0443\u0447\u0430\u0435\u043c \u043e\u043f\u0442\u0438\u043c\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0435 \u0441\u043e\u0447\u0435\u0442\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0441\u043a\u0440\u044b\u0442\u044b\u0445 \u043f\u0440\u0438\u0437\u043d\u0430\u043a\u043e\u0432 \u0434\u043b\u044f \u0440\u0435\u043a\u043e\u043d\u0441\u0442\u0440\u0443\u043a\u0446\u0438\u0438 \u0424\u0413.  \u041c\u044b \u043d\u0430\u0437\u044b\u0432\u0430\u0435\u043c \u044d\u0442\u043e \u0430\u0433\u0440\u0435\u0433\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c \u0432\u043d\u0438\u043c\u0430\u043d\u0438\u0435\u043c, \u043f\u043e\u0442\u043e\u043c\u0443 \u0447\u0442\u043e \u043e\u043d\u043e \u043e\u0431\u044a\u0435\u0434\u0438\u043d\u044f\u0435\u0442 3D-\u0441\u0435\u0433\u043c\u0435\u043d\u0442\u044b \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438 FG \u0434\u043b\u044f \u0444\u043e\u0440\u043c\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u043d\u0430\u0448\u0435\u0433\u043e \u0441\u043a\u0440\u044b\u0442\u043e\u0433\u043e \u0437\u0430\u043f\u0440\u043e\u0441\u0430.  \u0410\u0433\u0440\u0435\u0433\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u043e\u0435 \u0432\u043d\u0438\u043c\u0430\u043d\u0438\u0435 \u043e\u0442\u0432\u0435\u0447\u0430\u0435\u0442 \u0437\u0430 \u044d\u0444\u0444\u0435\u043a\u0442\u0438\u0432\u043d\u044b\u0439 \u043f\u0435\u0440\u0435\u0432\u043e\u0434 \u0438\u0437 \u0441\u043a\u0440\u044b\u0442\u043e\u0433\u043e \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f CG \u0432 \u0436\u0438\u0437\u043d\u0435\u0441\u043f\u043e\u0441\u043e\u0431\u043d\u044b\u0435 \u043a\u043e\u043e\u0440\u0434\u0438\u043d\u0430\u0442\u044b FG (\u0440\u0438\u0441. 1 (III)).<\/p>\n<h2 id=\"model\">\u041c\u043e\u0434\u0435\u043b\u044c<\/h2>\n<p>CoarsenConf \u2014 \u044d\u0442\u043e \u0438\u0435\u0440\u0430\u0440\u0445\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0439 VAE \u0441 SE(3)-\u044d\u043a\u0432\u0438\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u044b\u043c \u043a\u043e\u0434\u0438\u0440\u043e\u0432\u0449\u0438\u043a\u043e\u043c \u0438 \u0434\u0435\u043a\u043e\u0434\u0435\u0440\u043e\u043c.  \u041a\u043e\u0434\u0438\u0440\u043e\u0432\u0449\u0438\u043a \u043e\u043f\u0435\u0440\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442 SE(3)-\u0438\u043d\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u044b\u043c\u0438 \u0430\u0442\u043e\u043c\u043d\u044b\u043c\u0438 \u0441\u0432\u043e\u0439\u0441\u0442\u0432\u0430\u043c\u0438 $h \\in R^{ n \\times D}$ \u0438 SE(3)-\u044d\u043a\u0432\u0438\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u044b\u043c\u0438 \u0430\u0442\u043e\u043c\u0438\u0441\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u043c\u0438 \u043a\u043e\u043e\u0440\u0434\u0438\u043d\u0430\u0442\u0430\u043c\u0438 $x \\in R^{n \\times 3}$.  \u041e\u0434\u0438\u043d \u0441\u043b\u043e\u0439 \u043a\u043e\u0434\u0438\u0440\u043e\u0432\u0449\u0438\u043a\u0430 \u0441\u043e\u0441\u0442\u043e\u0438\u0442 \u0438\u0437 \u0442\u0440\u0435\u0445 \u043c\u043e\u0434\u0443\u043b\u0435\u0439: \u043c\u0435\u043b\u043a\u043e\u043c\u043e\u0434\u0443\u043b\u044c\u043d\u043e\u0433\u043e, \u043e\u0431\u044a\u0435\u0434\u0438\u043d\u044f\u044e\u0449\u0435\u0433\u043e \u0438 \u043a\u0440\u0443\u043f\u043d\u043e\u043c\u043e\u0434\u0443\u043b\u044c\u043d\u043e\u0433\u043e.  \u041f\u043e\u043b\u043d\u044b\u0435 \u0443\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u0434\u043b\u044f \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u043c\u043e\u0434\u0443\u043b\u044f \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043d\u0430\u0439\u0442\u0438 \u0432 \u043f\u043e\u043b\u043d\u043e\u0439 \u0441\u0442\u0430\u0442\u044c\u0435.  \u041a\u043e\u0434\u0435\u0440 \u0441\u043e\u0437\u0434\u0430\u0435\u0442 \u043e\u043a\u043e\u043d\u0447\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0439 \u044d\u043a\u0432\u0438\u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043d\u044b\u0439 \u0442\u0435\u043d\u0437\u043e\u0440 \u043a\u043e\u043c\u043f\u044c\u044e\u0442\u0435\u0440\u043d\u043e\u0439 \u0433\u0440\u0430\u0444\u0438\u043a\u0438 $Z \\in R^{N \\times F \\times 3}$, \u0433\u0434\u0435 $N$\u00a0\u2013 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u0431\u0443\u0441\u0438\u043d\u043e\u043a, \u0430 F\u00a0\u2013 \u0437\u0430\u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0439 \u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u0442\u0435\u043b\u0435\u043c \u0441\u043a\u0440\u044b\u0442\u044b\u0439 \u0440\u0430\u0437\u043c\u0435\u0440.<\/p>\n<p>\u0420\u043e\u043b\u044c \u0434\u0435\u043a\u043e\u0434\u0435\u0440\u0430 \u0434\u0432\u043e\u044f\u043a\u0430.  \u0412\u043e-\u043f\u0435\u0440\u0432\u044b\u0445, \u044d\u0442\u043e \u043f\u0440\u0435\u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0441\u043a\u0440\u044b\u0442\u043e\u0433\u043e \u043e\u0433\u0440\u0443\u0431\u043b\u0435\u043d\u043d\u043e\u0433\u043e \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f \u043e\u0431\u0440\u0430\u0442\u043d\u043e \u0432 \u043f\u0440\u043e\u0441\u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u0442\u0432\u043e FG \u0441 \u043f\u043e\u043c\u043e\u0449\u044c\u044e \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441\u0430, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0439 \u043c\u044b \u043d\u0430\u0437\u044b\u0432\u0430\u0435\u043c \u0432\u044b\u0431\u043e\u0440\u043e\u043c \u043a\u0430\u043d\u0430\u043b\u0430 \u0438 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0439 \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u0442 \u0430\u0433\u0440\u0435\u0433\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u043e\u0435 \u0432\u043d\u0438\u043c\u0430\u043d\u0438\u0435.  \u0412\u043e-\u0432\u0442\u043e\u0440\u044b\u0445, \u0430\u0432\u0442\u043e\u0440\u0435\u0433\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u043e\u043d\u043d\u043e\u0435 \u0443\u0442\u043e\u0447\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435 \u043c\u0435\u043b\u043a\u043e\u0437\u0435\u0440\u043d\u0438\u0441\u0442\u043e\u0433\u043e \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f \u0434\u043b\u044f \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f \u043e\u043a\u043e\u043d\u0447\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0445 \u043d\u0438\u0437\u043a\u043e\u044d\u043d\u0435\u0440\u0433\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0445 \u043a\u043e\u043e\u0440\u0434\u0438\u043d\u0430\u0442 (\u0440\u0438\u0441. 1 (IV)).<\/p>\n<p>\u041c\u044b \u043f\u043e\u0434\u0447\u0435\u0440\u043a\u0438\u0432\u0430\u0435\u043c, \u0447\u0442\u043e \u0437\u0430 \u0441\u0447\u0435\u0442 \u0433\u0440\u0443\u0431\u043e\u0439 \u0434\u0435\u0442\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u0438 \u043f\u043e \u0441\u0432\u044f\u0437\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438 \u0443\u0433\u043b\u0430 \u043a\u0440\u0443\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f \u043d\u0430\u0448\u0430 \u043c\u043e\u0434\u0435\u043b\u044c \u0438\u0437\u0443\u0447\u0430\u0435\u0442 \u043e\u043f\u0442\u0438\u043c\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u0443\u0433\u043b\u044b \u043a\u0440\u0443\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f \u0431\u0435\u0437 \u043f\u0440\u0438\u0441\u043c\u043e\u0442\u0440\u0430, \u043f\u043e\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u0443 \u0443\u0441\u043b\u043e\u0432\u043d\u044b\u0439 \u0432\u0432\u043e\u0434 \u0432 \u0434\u0435\u043a\u043e\u0434\u0435\u0440 \u043d\u0435 \u0432\u044b\u0440\u043e\u0432\u043d\u0435\u043d.  CoarsenConf \u0433\u0430\u0440\u0430\u043d\u0442\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442, \u0447\u0442\u043e \u043a\u0430\u0436\u0434\u044b\u0439 \u0441\u043b\u0435\u0434\u0443\u044e\u0449\u0438\u0439 \u0441\u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u0439 \u043f\u043e\u0434\u0433\u0440\u0430\u0444 \u043f\u0440\u0430\u0432\u0438\u043b\u044c\u043d\u043e \u043f\u043e\u0432\u0435\u0440\u043d\u0443\u0442 \u0434\u043b\u044f \u0434\u043e\u0441\u0442\u0438\u0436\u0435\u043d\u0438\u044f \u043d\u0438\u0437\u043a\u043e\u0439 \u043e\u0448\u0438\u0431\u043a\u0438 \u043a\u043e\u043e\u0440\u0434\u0438\u043d\u0430\u0442 \u0438 \u0440\u0430\u0441\u0441\u0442\u043e\u044f\u043d\u0438\u044f.<\/p>\n<h2 id=\"experimental-results\">\u0420\u0435\u0437\u0443\u043b\u044c\u0442\u0430\u0442\u044b \u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430<\/h2>\n<p style=\"text-align:center;\">\n<img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/bair.berkeley.edu\/static\/blog\/coarsenconf\/table1.png\" width=\"95%\"\/><br \/>\n<!-- <img decoding=\"async\" src=\"http:\/\/bair.berkeley.edu\/CoarsenConf\/table1.png\" width=\"95%\"> --><br \/>\n<br \/><i><b>\u0422\u0430\u0431\u043b\u0438\u0446\u0430 1<\/b>: \u041a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u0441\u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0430\u043d\u0441\u0430\u043c\u0431\u043b\u0435\u0439 \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440\u043e\u0432 \u0434\u043b\u044f \u0442\u0435\u0441\u0442\u043e\u0432\u043e\u0433\u043e \u043d\u0430\u0431\u043e\u0440\u0430 GEOM-DRUGS ($\\delta=0,75\u00c5$) \u0441 \u0442\u043e\u0447\u043a\u0438 \u0437\u0440\u0435\u043d\u0438\u044f \u043e\u0445\u0432\u0430\u0442\u0430 (%) \u0438 \u0441\u0440\u0435\u0434\u043d\u0435\u0433\u043e \u0441\u0440\u0435\u0434\u043d\u0435\u043a\u0432\u0430\u0434\u0440\u0430\u0442\u0438\u0447\u043d\u043e\u0433\u043e \u0441\u0442\u0430\u043d\u0434\u0430\u0440\u0442\u043d\u043e\u0433\u043e \u043e\u0442\u043a\u043b\u043e\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f ($\u00c5$).  CoarsenConf (5 \u044d\u043f\u043e\u0445) \u0431\u044b\u043b\u043e \u043e\u0433\u0440\u0430\u043d\u0438\u0447\u0435\u043d\u043e \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435\u043c 7,3% \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445, \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u043c\u044b\u0445 Torsional Diffusion (250 \u044d\u043f\u043e\u0445), \u0447\u0442\u043e\u0431\u044b \u043f\u0440\u043e\u0438\u043b\u043b\u044e\u0441\u0442\u0440\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0440\u0435\u0436\u0438\u043c \u0441 \u043d\u0438\u0437\u043a\u0438\u043c \u0443\u0440\u043e\u0432\u043d\u0435\u043c \u0432\u044b\u0447\u0438\u0441\u043b\u0435\u043d\u0438\u0439 \u0438 \u043e\u0433\u0440\u0430\u043d\u0438\u0447\u0435\u043d\u043d\u044b\u043c\u0438 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c\u0438.<\/i>\n<\/p>\n<p>\u0421\u0440\u0435\u0434\u043d\u044f\u044f \u043e\u0448\u0438\u0431\u043a\u0430 (AR) \u044f\u0432\u043b\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u043a\u043b\u044e\u0447\u0435\u0432\u043e\u0439 \u043c\u0435\u0442\u0440\u0438\u043a\u043e\u0439, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u0430\u044f \u0438\u0437\u043c\u0435\u0440\u044f\u0435\u0442 \u0441\u0440\u0435\u0434\u043d\u0435\u0435 \u0441\u0440\u0435\u0434\u043d\u0435\u043a\u0432\u0430\u0434\u0440\u0430\u0442\u0438\u0447\u043d\u043e\u0435 \u043e\u0442\u043a\u043b\u043e\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0434\u043b\u044f \u0441\u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0449\u0435\u0433\u043e \u043d\u0430\u0431\u043e\u0440\u0430 \u0442\u0435\u0441\u0442\u043e\u0432.  \u041f\u043e\u043a\u0440\u044b\u0442\u0438\u0435 \u0438\u0437\u043c\u0435\u0440\u044f\u0435\u0442 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u043d\u0442 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u043c\u043e\u0433\u0443\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c \u0441\u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u044b \u0432 \u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0430\u0445 \u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u043d\u043e\u0433\u043e \u043f\u043e\u0440\u043e\u0433\u0430 \u043e\u0448\u0438\u0431\u043a\u0438 ($\\delta$).  \u041c\u044b \u0432\u0432\u043e\u0434\u0438\u043c \u0441\u0440\u0435\u0434\u043d\u0438\u0435 \u0438 \u043c\u0430\u043a\u0441\u0438\u043c\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u043c\u0435\u0442\u0440\u0438\u043a\u0438, \u0447\u0442\u043e\u0431\u044b \u043b\u0443\u0447\u0448\u0435 \u043e\u0446\u0435\u043d\u0438\u0442\u044c \u043d\u0430\u0434\u0435\u0436\u043d\u0443\u044e \u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u044e \u0438 \u0438\u0437\u0431\u0435\u0436\u0430\u0442\u044c \u0441\u0438\u0441\u0442\u0435\u043c\u0430\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u043e\u0439 \u043e\u0448\u0438\u0431\u043a\u0438 \u0432\u044b\u0431\u043e\u0440\u043a\u0438 \u043c\u0438\u043d\u0438\u043c\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u043c\u0435\u0442\u0440\u0438\u043a\u0438.  \u041c\u044b \u043f\u043e\u0434\u0447\u0435\u0440\u043a\u0438\u0432\u0430\u0435\u043c, \u0447\u0442\u043e \u043c\u0438\u043d\u0438\u043c\u0430\u043b\u044c\u043d\u0430\u044f \u043c\u0435\u0442\u0440\u0438\u043a\u0430 \u0434\u0430\u0435\u0442 \u043d\u0435\u043e\u0441\u044f\u0437\u0430\u0435\u043c\u044b\u0435 \u0440\u0435\u0437\u0443\u043b\u044c\u0442\u0430\u0442\u044b, \u043f\u043e\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u0443, \u0435\u0441\u043b\u0438 \u043e\u043f\u0442\u0438\u043c\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0439 \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440 \u043d\u0435 \u0438\u0437\u0432\u0435\u0441\u0442\u0435\u043d \u0430\u043f\u0440\u0438\u043e\u0440\u0438, \u043d\u0435\u0432\u043e\u0437\u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u0443\u0437\u043d\u0430\u0442\u044c, \u043a\u0430\u043a\u043e\u0439 \u0438\u0437 \u0441\u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 2L \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440\u043e\u0432 \u0434\u043b\u044f \u043e\u0442\u0434\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044b \u044f\u0432\u043b\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u043b\u0443\u0447\u0448\u0438\u043c.  \u0422\u0430\u0431\u043b\u0438\u0446\u0430 1 \u043f\u043e\u043a\u0430\u0437\u044b\u0432\u0430\u0435\u0442, \u0447\u0442\u043e CoarsenConf \u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442 \u0441\u0430\u043c\u0443\u044e \u043d\u0438\u0437\u043a\u0443\u044e \u0441\u0440\u0435\u0434\u043d\u044e\u044e \u0438 \u043d\u0430\u0438\u0445\u0443\u0434\u0448\u0443\u044e \u043e\u0448\u0438\u0431\u043a\u0443 \u043f\u043e \u0432\u0441\u0435\u043c\u0443 \u0442\u0435\u0441\u0442\u043e\u0432\u043e\u043c\u0443 \u043d\u0430\u0431\u043e\u0440\u0443 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b DRUGS.  \u0414\u0430\u043b\u0435\u0435 \u043c\u044b \u043f\u043e\u043a\u0430\u0437\u044b\u0432\u0430\u0435\u043c, \u0447\u0442\u043e RDKit \u0441 \u043d\u0435\u0434\u043e\u0440\u043e\u0433\u043e\u0439 \u043e\u043f\u0442\u0438\u043c\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u0435\u0439 \u043d\u0430 \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u0435 \u0444\u0438\u0437\u0438\u043a\u0438 (MMFF) \u043e\u0431\u0435\u0441\u043f\u0435\u0447\u0438\u0432\u0430\u0435\u0442 \u043b\u0443\u0447\u0448\u0435\u0435 \u043f\u043e\u043a\u0440\u044b\u0442\u0438\u0435, \u0447\u0435\u043c \u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u0438\u043d\u0441\u0442\u0432\u043e \u043c\u0435\u0442\u043e\u0434\u043e\u0432, \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043d\u0430 \u0433\u043b\u0443\u0431\u043e\u043a\u043e\u043c \u043e\u0431\u0443\u0447\u0435\u043d\u0438\u0438.  \u0424\u043e\u0440\u043c\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f \u043c\u0435\u0442\u0440\u0438\u043a \u0438 \u0434\u0430\u043b\u044c\u043d\u0435\u0439\u0448\u0435\u0435 \u043e\u0431\u0441\u0443\u0436\u0434\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0441\u043c. \u0432 \u043f\u043e\u043b\u043d\u043e\u043c \u0434\u043e\u043a\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u0435, \u0441\u0441\u044b\u043b\u043a\u0430 \u043d\u0430 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0439 \u043f\u0440\u0438\u0432\u0435\u0434\u0435\u043d\u0430 \u043d\u0438\u0436\u0435.<\/p>\n<p>\u041f\u043e\u0434\u0440\u043e\u0431\u043d\u0435\u0435 \u043e CoarsenConf \u0447\u0438\u0442\u0430\u0439\u0442\u0435 \u0432 \u0441\u0442\u0430\u0442\u044c\u0435 \u043d\u0430 arXiv.<\/p>\n<h2 id=\"bibtex\">\u0411\u0438\u0431\u0422\u0435\u043a\u0441<\/h2>\n<p>\u0415\u0441\u043b\u0438 CoarsenConf \u0432\u0434\u043e\u0445\u043d\u043e\u0432\u043b\u044f\u0435\u0442 \u0432\u0430\u0448\u0443 \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u0443, \u0440\u0430\u0441\u0441\u043c\u043e\u0442\u0440\u0438\u0442\u0435 \u0432\u043e\u0437\u043c\u043e\u0436\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c \u0446\u0438\u0442\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f:<\/p>\n<div class=\"language-plaintext highlighter-rouge\">\n<div class=\"highlight\">\n<pre class=\"highlight\"><code>@article{reidenbach2023coarsenconf,\n      title={CoarsenConf: Equivariant Coarsening with Aggregated Attention for Molecular Conformer Generation},\n      author={Danny Reidenbach and Aditi S. Krishnapriyan},\n      journal={arXiv preprint arXiv:2306.14852},\n      year={2023},\n}\n<\/code><\/pre>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>\u0420\u0438\u0441\u0443\u043d\u043e\u043a 1: \u0410\u0440\u0445\u0438\u0442\u0435\u043a\u0442\u0443\u0440\u0430 CoarsenConf. \u0413\u0435\u043d\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u044f \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u044b\u0445 \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440\u043e\u0432 \u044f\u0432\u043b\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u0444\u0443\u043d\u0434\u0430\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447\u0435\u0439 \u0432\u044b\u0447\u0438\u0441\u043b\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u0445\u0438\u043c\u0438\u0438. \u0426\u0435\u043b\u044c \u0441\u043e\u0441\u0442\u043e\u0438\u0442 \u0432 \u0442\u043e\u043c, \u0447\u0442\u043e\u0431\u044b \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u043a\u0430\u0437\u0430\u0442\u044c \u0441\u0442\u0430\u0431\u0438\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u043d\u0438\u0437\u043a\u043e\u044d\u043d\u0435\u0440\u0433\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0435 \u0442\u0440\u0435\u0445\u043c\u0435\u0440\u043d\u044b\u0435 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u044b\u0435 \u0441\u0442\u0440\u0443\u043a\u0442\u0443\u0440\u044b, \u0438\u0437\u0432\u0435\u0441\u0442\u043d\u044b\u0435 \u043a\u0430\u043a \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0435\u0440\u044b, \u0441 \u0443\u0447\u0435\u0442\u043e\u043c \u0434\u0432\u0443\u043c\u0435\u0440\u043d\u043e\u0439 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044b. \u0422\u043e\u0447\u043d\u044b\u0435 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u044b\u0435 \u043a\u043e\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438 \u0438\u043c\u0435\u044e\u0442 \u0440\u0435\u0448\u0430\u044e\u0449\u0435\u0435 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0434\u043b\u044f \u0440\u0430\u0437\u043b\u0438\u0447\u043d\u044b\u0445 \u043f\u0440\u0438\u043b\u043e\u0436\u0435\u043d\u0438\u0439, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0437\u0430\u0432\u0438\u0441\u044f\u0442 \u043e\u0442 \u0442\u043e\u0447\u043d\u044b\u0445 \u043f\u0440\u043e\u0441\u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0438 \u0433\u0435\u043e\u043c\u0435\u0442\u0440\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0445 \u0445\u0430\u0440\u0430\u043a\u0442\u0435\u0440\u0438\u0441\u0442\u0438\u043a, \u0432\u043a\u043b\u044e\u0447\u0430\u044f \u043e\u0442\u043a\u0440\u044b\u0442\u0438\u0435 \u043b\u0435\u043a\u0430\u0440\u0441\u0442\u0432 \u0438 \u0441\u0442\u044b\u043a\u043e\u0432\u043a\u0443 \u0431\u0435\u043b\u043a\u043e\u0432. \u041c\u044b \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u044f\u0435\u043c [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":888,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[14],"tags":[],"class_list":{"0":"post-887","1":"post","2":"type-post","3":"status-publish","4":"format-standard","5":"has-post-thumbnail","7":"category-robotics"},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/gptmain.news\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/887","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/gptmain.news\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/gptmain.news\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gptmain.news\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gptmain.news\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=887"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/gptmain.news\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/887\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gptmain.news\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/media\/888"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/gptmain.news\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=887"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/gptmain.news\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=887"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/gptmain.news\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=887"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}